1941年8月，日军岗崎大队扫荡八路军根据地，暗地里，日军少佐吉川率领一支凶残善战的日军特别挺进杀人队将枪口悄悄对准了根据地黄崖山兵工厂的专家团们。
八路军特务团团长吕万才临危奉命支援阵地。突然，吕万才发现少了一个排的战士，侦察营长张大宝报告，在穿越黄崖山山梁的时候和一股日军小队发生了交火，由于着急赶到阻击集合地点，只留下了一个排的兵力进行追击。吕万才感到莫名的恐惧，他立即紧急回援。
特别挺进杀人队偷袭成功，兵工厂的专家团几乎全军覆没，张华清教授为了保护自己的实验数据紧紧同日军特战队员小野拉扯在一起，张大宝赶来营救，小野惊慌开枪射伤了张华清，仓促间扯下一页张华清手中的实验数据后撤退，挺进杀人队消失在山谷中。
张华清奄奄一息，临终遗言：自己的学生已在由德国返回中国的船上，他的代号叫“枪械师”，将借道上海来到黄崖山完成自己未尽的研究。
吕万才因作战失误面临军法处分。上级领导严斥吕万才，要求吕万才组织一支精干的小分队，赶往上海护送“枪械师”进入太行山根据地。“枪械师”是八路军军工研发的唯一希望，吕万才要么带回“枪械师”，要么军法处分!
电视剧枪械师剧照
北平日军华北派遣军总部，吉川少佐获得冈村宁次亲自颁发的帝国勋章。并得到最新任务：率领特别挺进杀人队赶往上海，截杀“枪械师”!
为带领小分队顺利进入上海，吕万才冒充土匪袭击晋绥军与上海大亨杰森做非法生意的商贸队，一场混战后，商贸队被控制关押在了一个小院里，为了保持与上海大亨杰森的联系，吕万才带上了商贸队的师爷葛师爷。
吕万才未到上海，日军已经给他一个下马威，上海日军情报中心，被俘中共江北特派员老肖遭受刑讯精神崩溃。老肖招供“枪械师”后天将会乘圣达西号邮轮抵达上海。八路军上海方面的接头人叫龙五湖。
枪械师剧情介绍第2集吕万才到达上海，杰森派管家何叔前来迎接，吕万才被安排在四方仓库，他老到的保卫措施被暗中窥视的杰森看在眼里，杰森对吕万才的身份产生疑问。
上海街头，地下党情报组长龙五湖被躲在轿车中的叛徒老肖认出，日军情报官美智郎命令特务小心跟踪，希望放长线钓大鱼，通过龙五湖抓住枪械师。
吕万才与龙五湖约定接头，龙五湖发现日本特务已经盯上了自己，自己已经暴露，眼看吕万才已经快走到接头地点，两个特务持枪对准了龙五湖，为了给吕万才示警，龙五湖开枪引发枪战，一场混战后，龙五湖牺牲。
吕万才看到龙五湖的牺牲，心如刀割。吕万才真的希望能够出手救龙五湖，但是自己的任务是不惜代价护送枪械师，看来这次任务远比自己想象的艰巨。
吉川少佐抵达上海，美智郎汇报吉川：根据情报可以锁定可能为“枪械师”的三人，即留德博士陆涯、刘春生和朱重阳。据悉，“枪械师”是德国冶炼专家海森博格教授的爱徒，目前日军正与德国情报部门联系，到学校去调查来确定谁是真正的“枪械师”。
吉川少佐不以为然，认为杀一个和杀三个没什么分别。日军上海情报部门的负责人田中大佐劝止了吉川。这三个小伙子背后都不是普通家庭。没明确“枪械师”是谁之前，这三个人都不能轻易动。德国盟友已经传过话来，后天上午九点前，也就是在圣达西号在浦西码头停靠前，将把“枪械师”的名字电传过来。
夜间，杰森为吕万才在天蟾大舞台接风，吕万才终于见到了这个神秘的上海滩大亨——杰森。杰森对吕万才百般试探，怀疑吕万才与八路有关系，幸亏吕万才的机智应变才应付过去。
杰森的管家何叔耳语，另一桌客人来了。杰森向吕万才告假离去，开门的一瞬吕万才发现几个日本军官的身影，吕万才借故让会读唇语的张大宝暗中了解他们说什么。
枪械师分集剧情介绍第3集田中大佐让杰森将一个黑皮箱带入租界码头，杰森爽快的答应了。暗中偷窥的大宝不小心弄出动静，小野持枪冲出，大宝掏出了飞刀，危险一触即发，但最终小野在快要找到大宝的时候停住了脚步。
吕万才在赌场偶然撞见了初恋女友、失踪多年的秋张。吕万才跟了过去，希望跟秋张有独处的机会。但这个愿望让张大宝引起的一场危机给破坏掉了。
大宝下楼与小野擦肩而过，大宝和他在黄崖山照过面，小野有所察觉，转身跟了上来。大宝碰上吕万才，向他汇报了田中让杰森往租界带箱子的事情。此时小野带了几名日本特务包抄了过来。大宝把飞刀扣在掌中，被吕万才拦住，危机时刻吕万才与在场的舞女、外国水手发生一场骚乱，骚乱中抢过一个酒瓶，砸在了大宝头上，大宝头破血流，一脸疑惑。恍然大悟后用血擦花了自己的脸。
田中和杰森来询问情况，吕万才表示大宝兄弟见到大胸脯的漂亮女人，难免动手动脚。杰森与田中一阵耳语，双方哈哈大笑。田中等人散去。小野告诉吉川，怀疑这些人是在黄崖山遭遇的八路，吉川意图去找吕万才询问，田中的情报官美智郎强硬的呵斥拦住了吉川，吉川愤愤离去。
杰森表示是自己疏忽了，明天安排吕万才兄弟们都到怡红楼，好好开开心。此时一个漂亮的女人走了过来挽住了杰森，杰森介绍这是自己的妻子，吕万才怔住，是自己的旧女友——秋张，两人无言握手，吕万才百感交集。
吕万才与杰森在门口告别的时候，四方仓库方向一道焰火带着啸声腾空而起。大宝大惊：“老大，我们中计了。”
原来2个小时前。吕万才乘车离开后，二十多个手持利斧的帮匪，偷袭四方仓库，却中了吕万才的埋伏，吕万才手下虎虎生风大展拳脚，匪徒纷纷被击倒。
吕万才和杰森等人赶到四方仓库。斧头帮头目刘三被反拢双臂跪在仓库前面，杰森表示，这个刘三还真不能毙，这个不孝之徒还跟自己真有渊源。
这时，周围黑压压的拢上来了四五十人，手持斧头。包围住杰森，大家紧张的注视着对面。大宝也要往前去对抗，吕万才拦住，让他悄悄找机会看看杰森皮箱里有什么东西。
斧头帮大亨龅牙洪嘻嘻哈哈走出人群，话中夹刺的要杰森放了刘三。在杰森和龅牙洪谈判的时候，大宝绕道人群后，刚打开杰森汽车的后备箱，却被杰森的司机觉察，大宝无功而返。
杰森放过了刘三，龅牙洪带手下离去，看着远处两帮人马散去，田中问吉川，刚才在天蟾大舞台到底出了什么事情，小野报告怀疑吕万才手下的人是八路，吉川认为山西阎老西的地盘和八路很近，而且又赶到了这个裉节上。田中点头认为这伙人来的蹊跷，这难道是巧合?吉川说我不相信巧合，这个世界上根本就没有巧合。
